Рт биология: Биология | Республиканский олимпиадный центр

Содержание

Биология | Республиканский олимпиадный центр

2020-2021

Скачать (4.8 Мб) Об итогах регионального этапа всероссийской олимпиады школьников в Республике Татарстан по биологии для обучающихся 9-11 классов в 2021 году
Скачать (70 Кб) Программа проведения заключительного этапа республиканской и регионального этапа всероссийской олимпиад школьников По биологии
Скачать (4.2 Мб) Об итогах заключительного этапа республиканской олимпиады школьников по биологии для обучающихся 8 классов в 2021 году

Скачать (28 Кб) Итоговый протокол обучающихся 9-11 классов регионального этапа всероссийской олимпиады школьников по предмету биология в 2020-2021 учебном году
Скачать (13 Кб) Итоговый протокол обучающихся 8 класса заключительного этапа республиканской олимпиады школьников по предмету биология в 2020-2021 учебном году

2019-2020

Скачать (13 Кб) Итоговый протокол заключительного этапа республиканской олимпиады по предмету биология в 2019-2020 учебном году
Скачать (16 Кб) Итоговый протокол регионального этапа всероссийской олимпиады по биологии
Скачать (1.
2 Мб)
Приказ МОиН РТ от 17.01.2020 №под-66/20″Об утверждении состава жюри регионального этапа всероссийской и заключительного этапа республиканской олимпиад школьников по биологии в 2019/2020 учебном году»
Скачать (3.4 Мб) Приказ МОиН РТ от 27.02.2020 №под-294/20″Об итогах регионального этапа всероссийской олимпиады школьников по биологии в 2020 году»

Скачать (4.8 Мб) Приказ МОиН РТ от 27.02.2020 №под-293/20″Об итогах заключительного этапа республиканской олимпиады школьников по биологии в 2020 году»
Скачать (120 Кб) Требования к организации и проведению регионального этапа всероссийской олимпиады школьников по биологии в 2019/20 учебном году
Скачать (72 Кб) ПРОГРАММА ПРОВЕДЕНИЯ ЗАКЛЮЧИТЕЛЬНОГО ЭТАПА РЕСПУБЛИКАНСКОЙ И РЕГИОНАЛЬНОГО ЭТАПА ВСЕРОССИЙСКОЙ ОЛИМПИАДЫ ШКОЛЬНИКОВ ПО БИОЛОГИИ

2018-2019

Скачать (44 Кб) Итоговый протокол заключительного этапа республиканской и регионального этапа всероссийской олимпиады школьников по предмету биология в 2018-2019 учебном году
Скачать (15 Кб) Итоговый протокол заключительного этапа республиканской олимпиады по предмету биология в 2018-2019 учебном году, 8класс
Скачать (15 Кб) Итоговый протокол регионального этапа ВсОШ по предмету биология в 2018-2019 учебном году (9 класс)
Скачать (16 Кб) Итоговый протокол регионального этапа ВсОШ по предмету биология в 2018-2019 учебном году (10 класс)
Скачать (30 Кб) Итоговый протокол регионального этапа ВсОШ по предмету биология в 2018-2019 учебном году (11 класс)

Биология.

9 класс. Рабочая тетрадь к учебнику С.Б. Данилова, Н.И. Романовой, А.И. Владимирской

Новикова С.Н.

Аннотация

Рабочая тетрадь к учебнику С. Б. Данилова, Н.И. Романовой, А.И. Владимирской Биология для 9 класса являются частью УМК по биологии для основной школы. Выполнение заданий, предложенных в тетради, позволяет учащимся овладеть универсальными учебными действиями и достигать метапредметных результатов обучения.

Дополнительная информация
Регион (Город/Страна где издана):М.
Год публикации:2018
Тираж:5000
Дополнительный тираж:Да
Ширина издания:16,5
Высота издания:
21
Толщина издания:0,5
Вес в гр. :180
Язык публикации:
Тип обложки:BC
Полный список лиц указанных в издании:Новикова С.Н. Данилов С.Б.

Нет отзывов о товаре


С этим товаром покупают

задания, ответы, решения.

Подготовка к ЦТ.
РЕАЛЬНЫЕ ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ ВАРИАНТЫ 2011−2020 ГОДОВ
ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2020
Централизованное тестирование по биологии 2020 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2020 года с решениями. Вариант 2.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2019
Централизованное тестирование по биологии 2019 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2019 года с решениями. Вариант 2.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2018
Централизованное тестирование по биологии 2018 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2018 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2018 года с решениями. Вариант 3.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2017
Демонстрационная версия ЦТ по биологии 2016−2017 учебного года с решениями.

Централизованное тестирование по биологии 2017 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2017 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2017 года с решениями. Вариант 3.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2016
Централизованное тестирование по биологии 2016 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2016 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2016 года с решениями. Вариант 3.

Централизованное тестирование по биологии 2016 года с решениями. Вариант 4.

Централизованное тестирование по биологии 2016 года с решениями. Вариант 5.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2015
Централизованное тестирование по биологии 2015 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2015 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2015 года с решениями. Вариант 3.

Централизованное тестирование по биологии 2015 года с решениями. Вариант 4.

Централизованное тестирование по биологии 2015 года с решениями. Вариант 5.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2014
Централизованное тестирование по биологии 2014 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2014 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2014 года с решениями. Вариант 3.

Централизованное тестирование по биологии 2014 года с решениями. Вариант 4.

Централизованное тестирование по биологии 2014 года с решениями. Вариант 5.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2013
Централизованное тестирование по биологии 2013 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2013 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2013 года с решениями. Вариант 3.

Централизованное тестирование по биологии 2013 года с решениями. Вариант 4.

Централизованное тестирование по биологии 2013 года с решениями. Вариант 5.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2012
Централизованное тестирование по биологии 2012 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2012 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2012 года с решениями. Вариант 3.

Централизованное тестирование по биологии 2012 года с решениями. Вариант 4.

Централизованное тестирование по биологии 2012 года с решениями. Вариант 5.

ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ РАБОТЫ ЦТ 2011
Централизованное тестирование по биологии 2011 года с решениями. Вариант 1.

Централизованное тестирование по биологии 2011 года с решениями. Вариант 2.

Централизованное тестирование по биологии 2011 года с решениями. Вариант 3.

Централизованное тестирование по биологии 2011 года с решениями. Вариант 4.

Централизованное тестирование по биологии 2011 года с решениями. Вариант 5.

ЦТ-2022 ждут большие изменения — Блог Гродно s13

На сайте РИКЗ опубликовали спецификации тестов по разным предметам, которые ждут абитуриентов-2022. Теперь на ЦТ у ребят будет больше времени на решение заданий по математике и физике: с трех часов его увеличили до 3,5 часов. По данным Минобразования, нововведения вступят в силу уже на втором этапе РТ, регистрация на которое уже идет.

Структура тестов заметно изменилась еще в прошлом году, когда количество заданий и правильных ответов по некоторым предметам стало другим.

Предмет Спецификация теста в 2022-м Изменения Время на тест
Математика А — 18, В — 14 С прошлого года в части А может быть правильными 1,2 и более ответов из пяти предложенных 210
Физика А — 18, В — 14 С прошлого года в части А может быть правильными 1,2 и более ответов из пяти предложенных 210
Обществоведение А — 28, В — 16   90
Биология А — 28, В — 16   120
Химия А — 28, В — 16   150
География А — 28, В — 16   90
Всемирная история (новейшее время) А — 28, В — 16   90
История Беларуси А — 28, В — 16   90
Иностранный (например, английский язык) А — 30, В — 18 В части А нужно выбрать один правильный ответ из пяти (трех) предложенных 120
Русский язык А — 30, В — 10 В части А, как и раньше, может быть один или несколько верных ответов 120
Белорусский язык А — 30, В — 10 В части А, как и раньше, может быть один или несколько верных ответов 120

Содержание тестов по некоторым предметам тоже изменится, например,новые темы появятся в ЦТ по математике и физике.

ГДЗ Биология 8 класс Сонин, Агафонова

  • Биология 8 класс
  • Тип пособия: Рабочая тетрадь
  • Авторы: Сонин, Агафонова
  • Издательство: «Дрофа»

Похожие ГДЗ Биология 8 класс

Задания: стр.6

Предыдущее

Следующее

Предыдущее

Следующее

Учебный курс восьмого класса познакомит учеников с таким разделом биологии как анатомия. Ребята узнают о жизненно важных системах организма, подробно разберут строение костной ткани, кровообращение, изучат защитные свойства организма, а также рассмотрят важные аспекты сохранения и поддержания здорового образа жизни.

К концу года они научатся:

  1. Классифицировать биологические объекты.
  2. Выделять существенные признаки живых организмов.
  3. Различать на чертежах органы.
  4. Понимать роль биологии в жизни людей.
  5. Применять на практике полученные знания.

Навыки и умения, которые ученики приобретают осваивая предмет крайне пригодятся в повседневной жизни, а также послужат хорошим фундаментом для дальнейшего профессионального образования.

Трудности освоения предмета

Изучение биологии считается достаточно непростым делом, так как включает в себя много небольших аспектов, которые, тем не менее, играют не последнюю роль. Кто-то из подростков может и не справляться с дисциплиной, именно для них и был создан решебник к учебнику «Биология 8 класс Рабочая тетрадь Сонин, Агафонова Дрофа».

Что в него включено

В данном издании представлено сто пятьдесят девять страниц на которых расположены подробные и максимально понятные онлайн-ответы. Отыскать нужное задание не составит ни какого труда, так как расположение номеров идентично учебному пособию. С их помощью ученик сможет:

  • закрепить, и проработать пройденный материал;
  • правильно выполнить, и оформить домашнюю работу;
  • наилучшим образом подготовиться к предстоящему уроку;
  • разобрать и понять особо сложную тему.

Доскональное изложение материала в «ГДЗ по Биологии 8 класс Сонин» предоставит школьникам возможность углубиться в тематику учебника и хорошо освоить изучаемое.

Нужен ли решебник

Школьный материал по-разному воспринимается учащимися. Большую роль играет и то, как учитель ведет свои уроки, ведь если он скучно и нудно рассказывает о предмете, то подростки навряд ли вообще будут воспринимать то, что он говорит. А понимание это очень важно, ведь многие школьники связывают с этим разделом биологии свое будущее. Именно в этом классе раскрываются основные представления о физиологии человека. Естественно, трудности бывают всегда — вот и здесь случается, что школьники испытывают затруднения с выполнением д/з. На помощь им готов прийти решебник к учебнику «Биология 8 класс Рабочая тетрадь Сонин Дрофа».

Когда от погоды болит голова. Что такое метеопатия и как с ней бороться

https://ria.ru/20220108/pogoda-1761973957.html

Когда от погоды болит голова. Что такое метеопатия и как с ней бороться

Когда от погоды болит голова. Что такое метеопатия и как с ней бороться — РИА Новости, 08. 01.2022

Когда от погоды болит голова. Что такое метеопатия и как с ней бороться

При смене погоды многие люди чувствуют себя хуже, нередко обостряются хронические болезни. Почему возникает метеозависимость, кто к этому склонен и как избежать РИА Новости, 08.01.2022

2022-01-08T08:00

2022-01-08T08:00

2022-01-08T08:02

наука

первый мгму имени сеченова

измиран

здоровье

психология

солнце

биология

погода

/html/head/meta[@name=’og:title’]/@content

/html/head/meta[@name=’og:description’]/@content

https://cdnn21.img.ria.ru/images/07e5/0c/02/1761798131_0:182:3072:1910_1920x0_80_0_0_4d5301ecaed103576a4c8cf629c0b27a.jpg

МОСКВА, 8 янв — РИА Новости, Татьяна Пичугина. При смене погоды многие люди чувствуют себя хуже, нередко обостряются хронические болезни. Почему возникает метеозависимость, кто к этому склонен и как избежать неприятных последствий — в материале РИА Новости.Как наш организм реагирует на погодуВо время Олимпийских и Параолимпийских игр, проходивших с конца июля в Токио, погода была непривычно капризная. То жара, то холод с ливнями, тайфун, наводнение. Сентябрь оказался не лучше. В поликлиниках участились жалобы на головные боли, дискомфорт в области шеи, плеч, пишут исследователи из Университета Токусимы. Были головокружения, психосоматические симптомы. Очень нетипично для японского лета.»Это метеозависимость, метеочувствительность. Еще используют термин «метеопатия». Этим давно занимаются, но как самостоятельную болезнь не рассматривают», — рассказывает кандидат медицинских наук Наталья Семененко, доцент кафедры терапии Сеченовского университета.Речь идет о различных симптомах, в основном болях, возникающих в ответ на изменения окружающей среды. Одни считают, что это реакция вегетативной нервной системы, другие указывают на дефицит различных химических медиаторов в организме, гормонов, таких как серотонин (определяет настроение) и мелатонин (регулирует сон).»Видимо, действуют оба механизма. Организм подстраивается под окружающую среду, вегетативная нервная система меняет частоту сердечных сокращений, дыхания. Для этого синтезируются определенные химические вещества. Сосуды расширяются или, наоборот, сужаются, соответственно меняется давление», — объясняет врач.Метеозависимость существует, но…В Советском Союзе метеочувствительность исследовали в рамках гелиобиологии — науки о влиянии солнечной активности на живые организмы, основанной русским ученым Александром Чижевским. И в наше время у него есть последователи. Так, в 2005-м Мария Рагульская из Института земного магнетизма и распространения радиоволн имени Н. В. Пушкова РАН защитила по этой теме кандидатскую диссертацию.»Они изучали, как на здоровых людях сказываются магнитные бури и другие метеовозмущения, и выявили триггерный механизм. Изменилась погода — участилось сердцебиение, заболела голова, суставы. Что интересно, для этого нужен не один какой-то погодный фактор, а несколько. Человек более чувствителен к совокупности внешних воздействий», — говорит Наталья Семененко.Просто от похолодания голова не заболит. «Сузятся поверхностные сосуды, например, рук, а тем, что внутри тела, ничего не будет. Нужен комплекс факторов: перепад атмосферного давления, температуры, влажности. Тогда организм перестраивается, включается вегетативная нервная система, гормоны-медиаторы. Эффект разный: у одних скачет давление, возникает спазм сосудов, отсюда головные боли. У других — отек суставов», — отмечает эксперт.В мире много исследований метеопатии, посвященных в основном попыткам найти связь между погодой и болями, но результаты противоречивы.»Например, американские ученые сопоставили миллионы обращений пожилых людей к врачу по поводу ревматоидных болей и дождливые дни. Никакой взаимосвязи не обнаружили. Скорее всего, потому что взяли только один фактор, а нужно несколько. На резкое изменение погоды организм отреагирует просто оттого, что пытается адаптироваться, особенно если пациент чем-то хронически болен: ему не хватает медиаторов, вегетативная нервная система дает сбои», — рассуждает доктор Семененко.Есть еще одна причина, которой не стоит пренебрегать, — самовнушение. «Человек себя настраивает: раз погода меняется, значит, у меня заболит голова. С этим бороться очень трудно. Тут нужен скорее психолог», — констатирует врач.В 2020-м в Японии изучили более 16 тысяч случаев погодозависимых симптомов. Больше половины пациентов жаловались на головную боль, остальные — на боли в шее и плечах, пояснице, суставах. Причем эти симптомы хорошо соотносились с реальным диагнозом. То есть метеозависимые болезни существуют, признают авторы работы. Однако, указывают они, люди с хроническими болезнями склонны преувеличивать недомогание. Они боятся двигаться, недооценивают свои возможности, могут поддаться панике. Им необходим комплекс физио- и психотерапии.

https://ria.ru/20190730/1556982005.html

https://ria.ru/20180414/1518620983.html

РИА Новости

[email protected]

7 495 645-6601

ФГУП МИА «Россия сегодня»

https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

2022

РИА Новости

[email protected]

7 495 645-6601

ФГУП МИА «Россия сегодня»

https://xn--c1acbl2abdlkab1og. xn--p1ai/awards/

Новости

ru-RU

https://ria.ru/docs/about/copyright.html

https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/

РИА Новости

[email protected]

7 495 645-6601

ФГУП МИА «Россия сегодня»

https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

https://cdnn21.img.ria.ru/images/07e5/0c/02/1761798131_268:0:2999:2048_1920x0_80_0_0_f1d21febb2f6c0c9e7c3950d0eac731f.jpg

РИА Новости

[email protected]

7 495 645-6601

ФГУП МИА «Россия сегодня»

https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

РИА Новости

[email protected]

7 495 645-6601

ФГУП МИА «Россия сегодня»

https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/

первый мгму имени сеченова, измиран, здоровье, психология, солнце, биология, погода

МОСКВА, 8 янв — РИА Новости, Татьяна Пичугина. При смене погоды многие люди чувствуют себя хуже, нередко обостряются хронические болезни. Почему возникает метеозависимость, кто к этому склонен и как избежать неприятных последствий — в материале РИА Новости.

Как наш организм реагирует на погоду

Во время Олимпийских и Параолимпийских игр, проходивших с конца июля в Токио, погода была непривычно капризная. То жара, то холод с ливнями, тайфун, наводнение. Сентябрь оказался не лучше. В поликлиниках участились жалобы на головные боли, дискомфорт в области шеи, плеч, пишут исследователи из Университета Токусимы. Были головокружения, психосоматические симптомы. Очень нетипично для японского лета.

«Это метеозависимость, метеочувствительность. Еще используют термин «метеопатия». Этим давно занимаются, но как самостоятельную болезнь не рассматривают», — рассказывает кандидат медицинских наук Наталья Семененко, доцент кафедры терапии Сеченовского университета.

Речь идет о различных симптомах, в основном болях, возникающих в ответ на изменения окружающей среды. Одни считают, что это реакция вегетативной нервной системы, другие указывают на дефицит различных химических медиаторов в организме, гормонов, таких как серотонин (определяет настроение) и мелатонин (регулирует сон).

«Видимо, действуют оба механизма. Организм подстраивается под окружающую среду, вегетативная нервная система меняет частоту сердечных сокращений, дыхания. Для этого синтезируются определенные химические вещества. Сосуды расширяются или, наоборот, сужаются, соответственно меняется давление», — объясняет врач.

30 июля 2019, 08:00НаукаУченые рассказали всю правду о метеозависимости

Метеозависимость существует, но…

В Советском Союзе метеочувствительность исследовали в рамках гелиобиологии — науки о влиянии солнечной активности на живые организмы, основанной русским ученым Александром Чижевским. И в наше время у него есть последователи. Так, в 2005-м Мария Рагульская из Института земного магнетизма и распространения радиоволн имени Н. В. Пушкова РАН защитила по этой теме кандидатскую диссертацию.

«Они изучали, как на здоровых людях сказываются магнитные бури и другие метеовозмущения, и выявили триггерный механизм. Изменилась погода — участилось сердцебиение, заболела голова, суставы. Что интересно, для этого нужен не один какой-то погодный фактор, а несколько. Человек более чувствителен к совокупности внешних воздействий», — говорит Наталья Семененко.

Просто от похолодания голова не заболит. «Сузятся поверхностные сосуды, например, рук, а тем, что внутри тела, ничего не будет. Нужен комплекс факторов: перепад атмосферного давления, температуры, влажности. Тогда организм перестраивается, включается вегетативная нервная система, гормоны-медиаторы. Эффект разный: у одних скачет давление, возникает спазм сосудов, отсюда головные боли. У других — отек суставов», — отмечает эксперт.

14 апреля 2018, 03:03НаукаСнижение активности Солнца улучшит самочувствие метеозависимых людей

В мире много исследований метеопатии, посвященных в основном попыткам найти связь между погодой и болями, но результаты противоречивы.

«Например, американские ученые сопоставили миллионы обращений пожилых людей к врачу по поводу ревматоидных болей и дождливые дни. Никакой взаимосвязи не обнаружили. Скорее всего, потому что взяли только один фактор, а нужно несколько. На резкое изменение погоды организм отреагирует просто оттого, что пытается адаптироваться, особенно если пациент чем-то хронически болен: ему не хватает медиаторов, вегетативная нервная система дает сбои», — рассуждает доктор Семененко.

Есть еще одна причина, которой не стоит пренебрегать, — самовнушение. «Человек себя настраивает: раз погода меняется, значит, у меня заболит голова. С этим бороться очень трудно. Тут нужен скорее психолог», — констатирует врач.

В 2020-м в Японии изучили более 16 тысяч случаев погодозависимых симптомов. Больше половины пациентов жаловались на головную боль, остальные — на боли в шее и плечах, пояснице, суставах. Причем эти симптомы хорошо соотносились с реальным диагнозом. То есть метеозависимые болезни существуют, признают авторы работы. Однако, указывают они, люди с хроническими болезнями склонны преувеличивать недомогание. Они боятся двигаться, недооценивают свои возможности, могут поддаться панике. Им необходим комплекс физио- и психотерапии.

Основы обратной транскрипции | Thermo Fisher Scientific

Первоначальная центральная догма молекулярной биологии утверждала, что ДНК транскрибируется в РНК, которая, в свою очередь, транслируется в белок. Однако эта концепция была поставлена ​​под сомнение в 1970-х годах, когда две группы ученых, одна под руководством Говарда Темина из Висконсинского университета, а другая под руководством Дэвида Балтимора из Массачусетского технологического института, независимо идентифицировали новые ферменты, связанные с репликацией РНК-вирусов, называемые ретровирусами [1,2]. ]. Эти ферменты превращают геном вирусной РНК в молекулу комплементарной ДНК (кДНК), которая затем способна интегрироваться в геном хозяина.Это РНК-зависимые ДНК-полимеразы, которые называются обратной транскриптазой, потому что, в отличие от потока ДНК-к-РНК в центральной догме, они транскрибируют матрицы РНК в молекулы кДНК (, рис. 1, ). В 1975 году Темин и Балтимор получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине (совместно с Ренато Дульбекко за родственную работу по вирусам, вызывающим опухоли) за их новаторскую работу по идентификации обратных транскриптаз [3].

Обратные транскриптазы были идентифицированы во многих организмах, включая вирусы, бактерии, животных и растения.В этих организмах общая роль обратной транскриптазы заключается в преобразовании последовательностей РНК в последовательности кДНК, которые способны встраиваться в различные области генома. Таким образом, обратная транскрипция способствует ( Рисунок 2 ):

  • Размножению ретровирусов, например, вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), вируса мышиного лейкоза Молони (M-MuLV) и вируса птичьего миелобластоза (AMV) [1]. ,2]
  • Генетическое разнообразие у эукариот за счет мобильных мобильных элементов, называемых ретротранспозонами [4]
  • Репликация хромосомных концов, называемых теломерами [5,6]
  • Синтез внехромосомных химерных элементов ДНК/РНК, называемых многокопийной одноцепочечной ДНК (мДНК) у бактерий [7,8]

Рисунок 2.Роль обратной транскриптазы в биологических системах. (A) Вирусная РНК подвергается обратной транскрипции для интеграции в геном хозяина. ( B ) При ретротранспозиции промежуточная РНК подвергается обратной транскрипции для вставки копий ДНК в другие области генома. ( C ) Теломеразная обратная транскриптаза (TERT) использует РНК в качестве матрицы для удлинения и поддержания концов эукариотических хромосом. ( D ) Обратная транскрипция является промежуточным этапом в образовании многокопийной одноцепочечной ДНК (мсДНК) у бактерий.

 

Хотя обратные транскриптазы играют функциональную роль в биологических системах, они также служат важными инструментами для изучения популяций РНК. Одним из первых протоколов молекулярной биологии с использованием обратных транскриптаз было производство кДНК для создания библиотек, содержащих ДНК-копии мРНК из клеток и тканей [9,10]. Эти библиотеки кДНК помогают понять активно экспрессируемые гены и их функции в определенный момент времени.

Несмотря на то, что создание библиотек кДНК было важным шагом вперед в характеристике экспрессируемых генов, исследования РНК с низким содержанием оставались нерешенными. Впоследствии они были решены путем разработки полимеразной цепной реакции (ПЦР) — метода амплификации небольших количеств генетического материала. Обратная транскрипция в сочетании с ПЦР или ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) позволяет обнаруживать РНК даже при очень низких уровнях экспрессии генов и прокладывает путь для обнаружения циркулирующих РНК, РНК-вирусов и слияний раковых генов в молекулярной диагностике [11]. -13].

Кроме того, кДНК служат матрицами в таких приложениях, как микрочипы и секвенирование РНК, для характеристики неизвестных РНК с высокой пропускной способностью [14-17].(Подробнее о приложениях обратной транскрипции.)

 

Основы обратной транскрипции | Thermo Fisher Scientific

Первоначальная центральная догма молекулярной биологии утверждала, что ДНК транскрибируется в РНК, которая, в свою очередь, транслируется в белок. Однако эта концепция была поставлена ​​под сомнение в 1970-х годах, когда две группы ученых, одна под руководством Говарда Темина из Висконсинского университета, а другая под руководством Дэвида Балтимора из Массачусетского технологического института, независимо идентифицировали новые ферменты, связанные с репликацией РНК-вирусов, называемые ретровирусами [1,2]. ].Эти ферменты превращают геном вирусной РНК в молекулу комплементарной ДНК (кДНК), которая затем способна интегрироваться в геном хозяина. Это РНК-зависимые ДНК-полимеразы, которые называются обратной транскриптазой, потому что, в отличие от потока ДНК-к-РНК в центральной догме, они транскрибируют матрицы РНК в молекулы кДНК (, рис. 1, ). В 1975 году Темин и Балтимор получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине (совместно с Ренато Дульбекко за родственную работу по вирусам, вызывающим опухоли) за их новаторскую работу по идентификации обратных транскриптаз [3].

Обратные транскриптазы были идентифицированы во многих организмах, включая вирусы, бактерии, животных и растения. В этих организмах общая роль обратной транскриптазы заключается в преобразовании последовательностей РНК в последовательности кДНК, которые способны встраиваться в различные области генома. Таким образом, обратная транскрипция способствует ( Рисунок 2 ):

  • Размножению ретровирусов, например, вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), вируса мышиного лейкоза Молони (M-MuLV) и вируса птичьего миелобластоза (AMV) [1]. ,2]
  • Генетическое разнообразие у эукариот за счет мобильных мобильных элементов, называемых ретротранспозонами [4]
  • Репликация хромосомных концов, называемых теломерами [5,6]
  • Синтез внехромосомных химерных элементов ДНК/РНК, называемых многокопийной одноцепочечной ДНК (мДНК) у бактерий [7,8]

Рисунок 2.Роль обратной транскриптазы в биологических системах. (A) Вирусная РНК подвергается обратной транскрипции для интеграции в геном хозяина. ( B ) При ретротранспозиции промежуточная РНК подвергается обратной транскрипции для вставки копий ДНК в другие области генома. ( C ) Теломеразная обратная транскриптаза (TERT) использует РНК в качестве матрицы для удлинения и поддержания концов эукариотических хромосом. ( D ) Обратная транскрипция является промежуточным этапом в образовании многокопийной одноцепочечной ДНК (мсДНК) у бактерий.

 

Хотя обратные транскриптазы играют функциональную роль в биологических системах, они также служат важными инструментами для изучения популяций РНК. Одним из первых протоколов молекулярной биологии с использованием обратных транскриптаз было производство кДНК для создания библиотек, содержащих ДНК-копии мРНК из клеток и тканей [9,10]. Эти библиотеки кДНК помогают понять активно экспрессируемые гены и их функции в определенный момент времени.

Несмотря на то, что создание библиотек кДНК было важным шагом вперед в характеристике экспрессируемых генов, исследования РНК с низким содержанием оставались нерешенными.Впоследствии они были решены путем разработки полимеразной цепной реакции (ПЦР) — метода амплификации небольших количеств генетического материала. Обратная транскрипция в сочетании с ПЦР или ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) позволяет обнаруживать РНК даже при очень низких уровнях экспрессии генов и прокладывает путь для обнаружения циркулирующих РНК, РНК-вирусов и слияний раковых генов в молекулярной диагностике [11]. -13].

Кроме того, кДНК служат матрицами в таких приложениях, как микрочипы и секвенирование РНК, для характеристики неизвестных РНК с высокой пропускной способностью [14-17]. (Подробнее о приложениях обратной транскрипции.)

 

Основы обратной транскрипции | Thermo Fisher Scientific

Первоначальная центральная догма молекулярной биологии утверждала, что ДНК транскрибируется в РНК, которая, в свою очередь, транслируется в белок. Однако эта концепция была поставлена ​​под сомнение в 1970-х годах, когда две группы ученых, одна под руководством Говарда Темина из Висконсинского университета, а другая под руководством Дэвида Балтимора из Массачусетского технологического института, независимо идентифицировали новые ферменты, связанные с репликацией РНК-вирусов, называемые ретровирусами [1,2]. ].Эти ферменты превращают геном вирусной РНК в молекулу комплементарной ДНК (кДНК), которая затем способна интегрироваться в геном хозяина. Это РНК-зависимые ДНК-полимеразы, которые называются обратной транскриптазой, потому что, в отличие от потока ДНК-к-РНК в центральной догме, они транскрибируют матрицы РНК в молекулы кДНК (, рис. 1, ). В 1975 году Темин и Балтимор получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине (совместно с Ренато Дульбекко за родственную работу по вирусам, вызывающим опухоли) за их новаторскую работу по идентификации обратных транскриптаз [3].

Обратные транскриптазы были идентифицированы во многих организмах, включая вирусы, бактерии, животных и растения. В этих организмах общая роль обратной транскриптазы заключается в преобразовании последовательностей РНК в последовательности кДНК, которые способны встраиваться в различные области генома. Таким образом, обратная транскрипция способствует ( Рисунок 2 ):

  • Размножению ретровирусов, например, вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), вируса мышиного лейкоза Молони (M-MuLV) и вируса птичьего миелобластоза (AMV) [1]. ,2]
  • Генетическое разнообразие у эукариот за счет мобильных мобильных элементов, называемых ретротранспозонами [4]
  • Репликация хромосомных концов, называемых теломерами [5,6]
  • Синтез внехромосомных химерных элементов ДНК/РНК, называемых многокопийной одноцепочечной ДНК (мДНК) у бактерий [7,8]

Рисунок 2.Роль обратной транскриптазы в биологических системах. (A) Вирусная РНК подвергается обратной транскрипции для интеграции в геном хозяина. ( B ) При ретротранспозиции промежуточная РНК подвергается обратной транскрипции для вставки копий ДНК в другие области генома. ( C ) Теломеразная обратная транскриптаза (TERT) использует РНК в качестве матрицы для удлинения и поддержания концов эукариотических хромосом. ( D ) Обратная транскрипция является промежуточным этапом в образовании многокопийной одноцепочечной ДНК (мсДНК) у бактерий.

 

Хотя обратные транскриптазы играют функциональную роль в биологических системах, они также служат важными инструментами для изучения популяций РНК. Одним из первых протоколов молекулярной биологии с использованием обратных транскриптаз было производство кДНК для создания библиотек, содержащих ДНК-копии мРНК из клеток и тканей [9,10]. Эти библиотеки кДНК помогают понять активно экспрессируемые гены и их функции в определенный момент времени.

Несмотря на то, что создание библиотек кДНК было важным шагом вперед в характеристике экспрессируемых генов, исследования РНК с низким содержанием оставались нерешенными. Впоследствии они были решены путем разработки полимеразной цепной реакции (ПЦР) — метода амплификации небольших количеств генетического материала. Обратная транскрипция в сочетании с ПЦР или ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) позволяет обнаруживать РНК даже при очень низких уровнях экспрессии генов и прокладывает путь для обнаружения циркулирующих РНК, РНК-вирусов и слияний раковых генов в молекулярной диагностике [11]. -13].

Кроме того, кДНК служат матрицами в таких приложениях, как микрочипы и секвенирование РНК, для характеристики неизвестных РНК с высокой пропускной способностью [14-17].(Подробнее о применении обратной транскрипции.)

 

Обратная транскриптаза — обзор

13.6 RT-MLPA для профилирования мРНК

Обратная транскриптаза MLPA (RT-MLPA) (Eldering et al. , 20 метода MLPA, который можно использовать для профилирования мРНК в качестве альтернативы ПЦР в реальном времени и микрочипам. Есть два основных различия между протоколом MLPA для РНК и исходным методом MLPA, разработанным для ДНК. Во-первых, RT-MLPA начинается с превращения мРНК в кДНК.Для этого к образцу РНК добавляют фермент обратную транскриптазу и специальную смесь праймеров ОТ. Эта смесь праймеров содержит по одному праймеру RT для каждого зонда MLPA. Праймеры RT расположены непосредственно ниже последовательностей-мишеней зонда. Таким образом, зонды, используемые в последующей реакции MLPA, комплементарны кДНК, а не мРНК. Преобразование в кДНК имеет важное значение, поскольку НАД-зависимые лигазы, такие как фермент лигаза-65, используемый в MLPA, не могут лигировать олигонуклеотиды зонда ДНК, которые гибридизуются с РНК.

Второе отличие состоит в том, что, когда это возможно, зонды RT-MLPA конструируются с границей экзона внутри их последовательности-мишени. Например, одна часть зонда RT-MLPA может гибридизоваться с последними 25 нуклеотидами экзона 1, в то время как другая часть гибридизуется с первыми 35 нуклеотидами экзона 2. Такая структура, охватывающая интроны, не позволяет зонду генерировать сигнал. на загрязнение (геномной) ДНК, которая часто присутствует в образцах РНК.

При сравнении RT-MLPA с профилированием мРНК с помощью микрочипов анализы RT-MLPA более трудоемки в разработке, имеют гораздо меньшую способность к мультиплексированию и меньший динамический диапазон.Преимуществами RT-MLPA по сравнению с микрочипами являются простота использования, гораздо более низкие затраты на образец и более низкое стандартное отклонение отдельных зондов. Кроме того, в RT-MLPA нет необходимости проводить реакцию мечения образца; он предлагает более высокую пропускную способность и способность различать последовательности, отличающиеся одним нуклеотидом. В клинических условиях было показано, что RT-MLPA является хорошей альтернативой микрочипам, поскольку он может количественно определять до 50 различных транскриптов в анализе с одной пробиркой, демонстрируя при этом превосходное соответствие ПЦР в реальном времени и микрочипам. результаты (Hess et al., 2004, 2007; Лок и др. , 2006 г.; Силлессен и др. , 2007).

Изменчивость уровней экспрессии РНК в сочетании с довольно низким динамическим диапазоном RT-MLPA означает, что набор зондов, который хорошо работает с образцами РНК, полученными из данной ткани, может потребовать корректировки при использовании на другой ткани. Уровень экспрессии РНК может варьироваться настолько сильно, что пиковые сигналы высокоэкспрессируемых генов могут зашкаливать. Включение так называемых олигонуклеотидов-конкурентов в смесь зондов позволяет проводить тканеспецифическую тонкую настройку анализов RT-MLPA.Эти конкуренты конкурируют с данным зондом, потому что они предназначены для распознавания той же последовательности-мишени, что и один из двух олигонуклеотидов зонда. Хотя конкурент будет связываться с последовательностью-мишенью и даже может быть лигирован со вторым олигонуклеотидом зонда, полученный продукт никогда не будет амплифицирован, поскольку у конкурента, в отличие от настоящего зонда, отсутствует полная последовательность праймера для ПЦР. Как следствие, конкуренция между конкурентом и зондом за ограниченные участки-мишени снижает сигнал пикового сигнала зонда.Простое включение одного или нескольких из этих конкурентов позволяет «демпфировать» определенные пиковые сигналы, тем самым делая возможным их количественную оценку снова.

Важным преимуществом RT-MLPA является возможность использования сильно расщепленной РНК, такой как РНК, полученная из тканей FFPE. В MRC-Holland были получены обнадеживающие результаты на образцах РНК из предметных стекол, которые хранились при комнатной температуре в течение многих лет. Небольших участков кДНК достаточно для генерации сигналов зонда RT-MLPA, поскольку специфичные для зонда праймеры RT, поставляемые с набором зондов RT-MLPA, могут частично перекрываться с соответствующим зондом и должны быть удлинены всего на 50 нуклеотидов.Кроме того, использование одного специального ОТ-праймера для каждого зонда уравнивает эффективность преобразования мРНК в кДНК, делая его менее зависимым от содержания GC и степени разрушения РНК по сравнению с использованием гексамеров или олиго-dT.

Новый и универсальный метод нормализации данных RT-qPCR микроРНК | Биология генома

  • 1.

    Эскела-Кершер А., Слэк Ф.Дж.: Онкомиры — микроРНК, играющие роль в развитии рака. Нат Рев Рак. 2006, 6: 259-269. 10.1038/nrc1840.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 2.

    Lu J, Getz G, Miska EA, Alvarez-Saavedra E, Lamb J, Peck D, Sweet-Cordero A, Ebert BL, Mak RH, Ferrando AA, Downing JR, Jacks T, Horvitz HR, Golub TR: Профили экспрессии микроРНК классифицировать рак человека. Природа. 2005, 435: 834-838. 10.1038/природа03702.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 3.

    Барад О., Мейри Э., Авниел А., Ааронов Р., Барзилай А., Бентвич И., Эйнав У., Гилад С., Хурбан П., Каров Ю., Лобенхофер Э.К., Шарон Э., Шиболет Ю.М., Штутман М., Бентвич З. , Einat P: Экспрессия микроРНК, обнаруженная с помощью микрочипов олигонуклеотидов: создание системы и профилирование экспрессии в тканях человека. Геном Res. 2004, 14: 2486-2494. 10.1101/гр.2845604.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 4.

    Castoldi M, Schmidt S, Benes V, Noerholm M, Kulozik AE, Hentze MW, Muckenthaler MU: чувствительный массив для профилирования экспрессии микроРНК (miChip) на основе закрытых нуклеиновых кислот (LNA). рна. 2006, 12: 913-920. 10.1261/РНК.2332406.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 5.

    Liu CG, Calin GA, Meloon B, Gamliel N, Sevignani C, Ferracin M, Dumitru CD, Shimizu M, Zupo S, Dono M, Alder H, Bullrich F, Negrini M, Croce CM: олигонуклеотидный микрочип для всего генома Профилирование микроРНК в тканях человека и мыши. Proc Natl Acad Sci USA. 2004, 101: 9740-9744. 10.1073/пнас.0403293101.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 6.

    Нельсон П.Т., Болдуин Д.А., Скирс Л.М., Оберхолцер Дж.К., Тобиас Дж.В., Мурелатос З.: Высокопроизводительное профилирование экспрессии генов микроРНК на основе микрочипов.Нат Методы. 2004, 1: 155-161. 10.1038/nmeth717.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 7.

    Sioud M, Rosok O: Профилирование экспрессии микроРНК с использованием чувствительных зондов кДНК и массивов фильтров. Биотехнологии. 2004, 37: 574-576. 578-580.

    ПабМед КАС Google Scholar

  • 8.

    Thomson JM, Parker J, Perou CM, Hammond SM: Специальная платформа микрочипов для анализа экспрессии генов микроРНК.Нат Методы. 2004, 1: 47-53. 10.1038/nmeth704.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 9.

    Chen C, Ridzon DA, Broomer AJ, Zhou Z, Lee DH, Nguyen JT, Barbisin M, Xu NL, Mahuvakar VR, Andersen MR, Lao KQ, Livak KJ, Guegler KJ: количественная оценка в реальном времени микроРНК с помощью стволовой петли RT-PCR. Нуклеиновые Кислоты Res. 2005, 33: e179-10.1093/nar/gni178.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 10.

    Местдаг П., Фейс Т., Бернард Н., Гюнтер С., Чен С., Спелеман Ф., Вандесомпеле Дж.: Профилирование экспрессии микроРНК методом стволовой петли RT-qPCR с высокой пропускной способностью с использованием незначительных количеств входной РНК. Нуклеиновые Кислоты Res. 2008, 36: e143-10.1093/nar/gkn725.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 11.

    Vandesompele J, De Preter K, Pattyn F, Poppe B, Van Roy N, De Paepe A, Speleman F: Точная нормализация количественных данных RT-PCR в реальном времени путем геометрического усреднения нескольких генов внутреннего контроля.Геном биол. 2002, 3: RESEARCH0034-10.1186/gb-2002-3-7-research0034.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 12.

    Peltier HJ, Latham GJ: Нормализация уровней экспрессии микроРНК в количественных анализах ОТ-ПЦР: идентификация подходящих эталонных РНК-мишеней в нормальных и раковых твердых тканях человека. рна. 2008, 14: 844-852. 10.1261/РНК.939908.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 13.

    Workman C, Jensen LJ, Jarmer H, Berka R, Gautier L, Nielser HB, Saxild HH, Nielsen C, Brunak S, Knudsen S: Новый метод нелинейной нормализации для снижения изменчивости в экспериментах с ДНК-микрочипами. Геном биол. 2002, 3: RESEARCH0048-10.1186/gb-2002-3-9-research0048.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 14.

    Lefever S, Hellemans J, Pattyn F, Przybylski DR, Taylor C, Geurts R, Untergasser A, Vandesompele J, консорциум RDML: RDML: структурированный язык и рекомендации по отчетности для количественных данных ПЦР в реальном времени. Нуклеиновые Кислоты Res. 2009, 37: 2065-2069. 10.1093/нар/гкп056.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 15.

    Andersen CL, Jensen JL, Orntoft TF: Нормализация количественных данных ПЦР с обратной транскрипцией в режиме реального времени: основанный на модели подход к оценке дисперсии для определения генов, подходящих для нормализации, применительно к наборам данных рака мочевого пузыря и толстой кишки. Рак рез. 2004, 64: 5245-5250. 10.1158/0008-5472.CAN-04-0496.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 16.

    Sysi-Aho M, Katajamaa M, Yetukuri L, Oresic M: Метод нормализации данных метаболомики с использованием оптимального выбора нескольких внутренних стандартов. Биоинформатика BMC. 2007, 8: 93-10.1186/1471-2105-8-93.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 17.

    Wu W, Dave N, Tseng GC, Richards T, Xing EP, Kaminski N: Сравнение методов нормализации для данных CodeLink Bioarray.Биоинформатика BMC. 2005, 6: 309-10.1186/1471-2105-6-309.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 18.

    Fontana L, Fiori ME, Albini S, Cifaldi L, Giovinazzi S, Forloni M, Boldrini R, Donfrancesco A, Federici V, Giacomini P, Peschle C, Fruci D: Антагомир-17-5p подавляет рост резистентной к терапии нейробластомы через p21 и BIM. ПЛОС ОДИН. 2008, 3: e2236-10.1371/journal.pone.0002236.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 19.

    O’Donnell KA, Wentzel EA, Zeller KI, Dang CV, Mendell JT: c-Myc-регулируемые микроРНК модулируют экспрессию E2F1. Природа. 2005, 435: 839-843. 10.1038/природа03677.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 20.

    Chen Y, Stallings RL: Дифференциальные паттерны экспрессии микроРНК при нейробластоме коррелируют с прогнозом, дифференцировкой и апоптозом. Рак рез. 2007, 67: 976-983. 10.1158/0008-5472.CAN-06-3667.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 21.

    Schulte JH, Horn S, Otto T, Samans B, Heukamp LC, Eilers UC, Krause M, Astrahantseff K, Klein-Hitpass L, Buettner R, Schramm A, Christiansen H, Eilers M, Eggert A, Berwanger B: MYCN регулирует онкогенные микроРНК при нейробластоме. Инт Джей Рак. 2008, 122: 699-704. 10.1002/ijc.23153.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 22.

    He L, Thomson JM, Hemann MT, Hernando-Monge E, Mu D, Goodson S, Powers S, Cordon-Cardo C, Lowe SW, Hannon GJ, Hammond SM: Полицистрон микроРНК как потенциальный человек онкоген.Природа. 2005, 435: 828-833. 10.1038/природа03552.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 23.

    Gilsbach R, Kouta M, Bonisch H, Bruss M: Сравнение in vitro и in vivo эталонных генов для внутренней стандартизации данных ПЦР в реальном времени. Биотехнологии. 2006, 40: 173-177. 10.2144/000112052.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 24.

    Huggett J, Dheda K, Bustin S, Zumla A: нормализация ОТ-ПЦР в реальном времени; стратегии и соображения. Гены Иммун. 2005, 6: 279-284. 10.1038/sj.gene.6364190.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 25.

    Саркар Д., Паркин Р., Вайман С., Бендорайт А., Сатер С., Делроу Дж., Годвин А.К., Дрешер С., Хубер В., Джентльмен Р., Тевари М.: Оценка качества и анализ данных для массивов экспрессии микроРНК. Нуклеиновые Кислоты Res.2009, 37: e17-10.1093/nar/gkn932.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 26.

    Smith RD, Brown B, Ikonomi P, Schechter AN: Экзогенная эталонная РНК для нормализации количественной ПЦР в реальном времени. Биотехнологии. 2003, 34: 88-91.

    ПабМед КАС Google Scholar

  • 27.

    Hu SJ, Ren G, Liu JL, Zhao ZA, Yu YS, Su RW, Ma XH, Ni H, Lei W, Yang ZM: Экспрессия и регуляция микроРНК в матке мыши во время имплантации эмбриона.Дж. Биол. Хим. 2008, 283: 23473-23484. 10.1074/jbc.M800406200.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 28.

    Ohlsson Teague EM, Hoek Van der KH, Hoek Van der MB, Perry N, Wagaarachchi P, Robertson SA, Print CG, Hull LM: Регулируемые микроРНК пути, связанные с эндометриозом. Мол Эндокринол. 2009, 23: 265-275. 10.1210/м.2008-0387.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 29.

    Прадерванд С., Вебер Дж., Томас Дж., Буэно М., Вирапати П., Лефорт К., Дотто Г.П., Харшман К.: Влияние нормализации на профилирование экспрессии микрочипов микроРНК. рна. 2009, 15: 493-501. 10.1261/РНК.1295509.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 30.

    Цур Г., Леви А., Мейри Э., Барад О., Спектор Ю., Бентвич З., Мизрахи Л., Катценелленбоген М., Бен-Шушан Э., Реубинофф Б.Е., Галун Э.: Паттерны экспрессии микроРНК и их функция в энтодермальной дифференцировке эмбриональные стволовые клетки человека.ПЛОС ОДИН. 2008, 3: e3726-10.1371/journal.pone.0003726.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 31.

    Wang LL, Zhang Z, Li Q, Yang R, Pei X, Xu Y, Wang J, Zhou SF, Li Y: Воздействие этанола вызывает дифференцированную экспрессию микроРНК и генов-мишеней, а также тератогенные эффекты, которые можно подавить добавка фолиевой кислоты. Хум Репрод. 2009, 24: 562-579. 10.1093/humrep/den439.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 32.

    Chang TC, Yu D, Lee YS, Wentzel EA, Arking DE, West KM, Dang CV, Thomas-Tikhonenko A, Mendell JT: широко распространенная репрессия микроРНК с помощью Myc способствует онкогенезу. Нат Жене. 2008, 40: 43-50. 10.1038/нг.2007.30.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 33.

    Lee EJ, Baek M, Gusev Y, Brackett DJ, Nuovo GJ, Schmittgen TD: Систематическая оценка паттернов процессинга микроРНК в тканях, клеточных линиях и опухолях.рна. 2008, 14: 35-42. 10.1261/РНК.804508.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 34.

    Venturini L, Battmer K, Castoldi M, Schulteis B, Hochhaus A, Muckenthaler MU, Ganser A, Eder M, Scherr M: Экспрессия полицистрона miR-17-92 при хроническом миелоидном лейкозе (CML) CD34+ клетки. Кровь. 2007, 109: 4399-4405. 10.1182/кровь-2006-09-045104.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 35.

    База данных MYCNot. [http://medgen.ugent.be/MYCNot]

  • 36.

    Hernandez N: Гены малых ядерных РНК: модельная система для изучения фундаментальных механизмов транскрипции. Дж. Биол. Хим. 2001, 276: 26733-26736. 10.1074/jbc.R100032200.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 37.

    Ван Влиерберг П., ван Гротель М., Беверлоо Х.Б., Ли С., Хелгасон Т., Буйс-Гладдинс Дж., Пассиер М., ван Веринг Э.Р., Веерман А.Дж., Кампс В.А., Мейеринк Дж.П., Питерс Р.: Загадочная хромосома Делеция del(11)(p12p13) как новый механизм активации LMO2 при остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе у детей.Кровь. 2006, 108: 3520-3529. 10.1182/кровь-2006-04-019927.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 38.

    Bustin SA, Benes V, Garson JA, Hellemans J, Huggett J, Kubista M, Mueller R, Nolan T, Pfaffl MW, Shipley GL, Vandesompele J, Wittwer CT: Руководство MIQE: минимум информации для публикации количественных экспериментов ПЦР в реальном времени. Клин Хим. 2009, 55: 611-622. 10.1373/клинхем.2008.112797.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 39. Руководство

    MIQE. [http://www.rdml.org/miqe]

  • 40.

    Язык разметки данных ПЦР в реальном времени (RDML). [http://www.rdml.org]

  • 41.

    Hellemans J, Mortier G, De Paepe A, Speleman F, Vandesompele J: Система относительного количественного определения qBase и программное обеспечение для управления и автоматизированного анализа количественной ПЦР в реальном времени данные. Геном биол. 2007, 8: R19-10.1186/gb-2007-8-2-r19.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 42.

    Megraw M, Sethupathy P, Corda B, Hatzigeorgiou AG: miRGen: база данных для изучения геномной организации и функции микроРНК животных. Нуклеиновые Кислоты Res. 2007, 35: Д149-155. 10.1093/нар/гкл904.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 43.

    Вестерманн Ф., Мут Д., Беннер А., Бауэр Т., Генрих К.О., Обертуер А., Брорс Б. , Бейссбарт Т., Вандесомпеле Дж., Паттин Ф., Герой Б., Кониг Р., Фишер М., Шваб М.: Отличительная транскрипция Активность MYCN/c-MYC связана со спонтанной регрессией или злокачественным прогрессированием нейробластом.Геном биол. 2008, 9: R150-10.1186/GB-2008-9-10-R150.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 44.

    Slack A, Chen Z, Tonelli R, Pule M, Hunt L, Pession A, Shohet JM: Регуляторный ген p53 MDM2 является прямой мишенью транскрипции MYCN при нейробластоме. Proc Natl Acad Sci USA. 2005, 102: 731-736. 10.1073/пнас.0405495102.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 45.

    qBase Plus . [http://www.qbaseplus.com]

  • 46.

    RTPrimerDB. [http://www.rtprimerdb.org]

  • 47.

    Лефевер С., Вандесомпеле Дж., Спелеман Ф., Паттин Ф.: RTPrimerDB: портал праймеров и зондов для ПЦР в реальном времени. Нуклеиновые Кислоты Res. 2009, 37: Д942-Д945. 10.1093/нар/гкн777.

    ПабМед КАС ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 48.

    Castoldi M, Schmidt S, Benes V, Hentze MW, Muckenthaler MU: miChip: основанный на матрице метод профилирования экспрессии микроРНК с использованием закрытых зондов захвата нуклеиновых кислот.Нат Проток. 2008, 3: 321-329. 10.1038/нпрот.2008.4.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • 49.

    Райх М., Лифельд Т., Гулд Дж., Лернер Дж., Тамайо П., Месиров Дж.П.: GenePattern 2.0. Нат Жене. 2006, 38: 500-501. 10.1038/нг0506-500.

    ПабМед КАС Статья Google Scholar

  • Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

    Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности.Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


    Настройка браузера на прием файлов cookie

    Существует множество причин, по которым файл cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее распространенные причины:

    • В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки браузера, чтобы принять файлы cookie, или спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
    • Ваш браузер спрашивает, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файл cookie.
    • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Попробуйте другой браузер, если вы подозреваете это.
    • Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы это исправить, установите правильное время и дату на своем компьютере.
    • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie. Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

    Почему этому сайту требуются файлы cookie?

    Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Предоставить доступ без файлов cookie потребует от сайта создания нового сеанса для каждой посещаемой вами страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


    Что сохраняется в файле cookie?

    Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в файле cookie; никакая другая информация не фиксируется.

    Как правило, в файле cookie может храниться только та информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, если вы не решите ввести его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступ к остальной части вашего компьютера, и только сайт, создавший файл cookie, может его прочитать.

    RT-qPCR демонстрирует светозависимую экспрессию мРНК AtRBCS1A и AtRBCS3B в листьях Arabidopsis thaliana

    Количественная полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (RT-qPCR) широко используется в диагностике и исследованиях для определения специфической экспрессии мРНК в клетках.По мере увеличения количества приложений RT-qPCR необходимо предоставить студентам практический опыт использования этой современной техники. Здесь мы сообщаем о 3-недельном лабораторном упражнении с использованием RT-qPCR для демонстрации светозависимой экспрессии генов AtRBCS1A и AtRBCS3B, кодирующих две малые субъединицы Arabidopsis thaliana рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилазы / оксигеназы (Rubisco). В первую неделю студенты очищали и количественно определяли общую РНК из листьев A. thaliana, предварительно обработанных в темноте в течение 96 часов, и необработанных контролей.На второй неделе образцы РНК разделяли электрофорезом в формальдегидном геле и использовали для RT-qPCR. Студенты рассчитали экспрессию двух генов в темных обработанных листьях в процентах от таковой в контроле, используя метод 2(-ΔΔC) T и собранные CT. На третьей неделе были обобщены и обсуждены классовые КТ, кривые плавления, расчеты студентов и факторы, влияющие на надежность результатов RT-qPCR. Результаты студентов показывают, что (i) получены относительно чистые и интактные образцы РНК; (ii) ACTIN2 является лучшим эталонным геном, чем 18S рРНК; (iii) обработка в темноте снижает экспрессию обоих генов до <1%; (iv) снижение экспрессии AtRBCS3B значительно больше, чем у AtRBCS1A.Результаты до- и послелабораторных тестов показывают, что помимо теории, это упражнение помогает учащимся изучить приложения и связанные с ними методы RT-qPCR. Также обсуждаются будущие модификации и новые эксперименты, которые могут быть разработаны на основе результатов обучения и оценок учащихся.